Jedną z prawdopodobnych przyczyn wielu prążków w PCR jest niespecyficzne przyłączanie starterów. ... Zbyt wiele cykli PCR (ponad 30) może również powodować powstawanie wielu prążków ze względu na zwiększone prawdopodobieństwo błędu w każdym cyklu. Innym możliwym czynnikiem jest zanieczyszczenie DNA.
- Dlaczego w elektroforezie żelowej występuje wiele pasm??
- Jak rozwiązywać problemy z wieloma pasmami w PCR??
- Czym są pasma PCR??
- Dlaczego w RAPD jest wiele pasm??
Dlaczego w elektroforezie żelowej występuje wiele pasm??
Matryca żelowa działa jak sito: mniejsze cząsteczki DNA migrują szybciej niż większe, więc cząsteczki DNA o różnych rozmiarach rozdzielają się na odrębne pasma podczas elektroforezy.
Jak rozwiązywać problemy z wieloma pasmami w PCR??
Popularne odpowiedzi (1)
- wykonać reakcję z kontrolą ujemną (bez szablonu). ...
- Zwiększ temperaturę wyżarzania. ...
- Przeprojektuj podkłady i wydłuż 3′. ...
- Wydłuż czas wyżarzania, jeśli niespecyficzne produkty są krótsze od docelowego. ...
- Użyj mniej szablonu DNA.
- Wypróbuj PCR dotykiem.
Czym są pasma PCR??
Słaby górny prążek (298 pz) identyfikuje produkt PCR amplifikowany z jednego celu w genomie. Jaśniejszy dolny prążek (238 pz) identyfikuje wielocelowy produkt PCR z 10 kopiami powtórzeń w tym samym genomie. Oba te regiony docelowe zawierają w 100% identyczne miejsca wiązania dla starterów.
Dlaczego w RAPD jest wiele pasm??
Ponieważ RAPD są generowane przez losowe przyłączanie przy użyciu 10-nukleotydowego startera, można oczekiwać, że po każdym użytym starterze będzie pewna liczba fragmentów. ... W zależności od tego, co porównujesz (mniej lub bardziej spokrewnione genetycznie), liczba prążków polimorficznych będzie się różnić.